Rezerwat Karsiborska Kępa usytuowany jest w północno-zachodnim zakątku Polski, w odległości około 8 km od centrum Świnoujścia. Położony jest on w obszarze delty rzeki Świny na wyspie Karsiborska Kępa. Najbliższą zamieszkałą wyspą jest wyspa Karsibór, poprzez którą dociera się do rezerwatu, a na której nasi goście mogą znaleźć kwatery noclegowe i sklepy.
Do rezerwatu można dotrzeć w następujący sposób:
Autobusem miejskim linii nr 5, który rusza spod dworca kolejowego w Świnoujściu. Trzeba jechać do przedostatniego przystanku, następnie podążając za autobusem dojść do dużego przydrożnego krzyża i przy nim skręcić w lewo. Boczna droga z niewielkim mostkiem to wejście na Karsiborską Kępę.
Autobusem miejskim linii nr 5T, który kursuje z centrum Świnoujścia przez nowo otwarty tunel pod rzeką Świną. Podobnie jak w przypadku linii 5 trzeba jechać do przedostatniego przystanku, następnie podążając za autobusem dojść do dużego przydrożnego krzyża i przy nim skręcić w lewo. Boczna droga z niewielkim mostkiem to wejście na Karsiborską Kępę
Samochodem lub rowerem. Należy kierować się w stronę przeprawy promowej Karsibór (od strony wyspy Wolin) a następnie, tuż przed przeprawą skręcić na południe za drogowskazem Karsibór, dalej jechać cały czas asfaltową drogą do napotkania wspomnianego wyżej krzyża. Dodatkowo można zwracać uwagę na znaki drogowe „Ostoja Ptaków”.